根据遗迹中残留的线索，李晓慧和考察队踏上了寻找宝石的征程。他们首先来到一座古老的山洞前，据说这里曾是古代修行者的居所，很可能藏着代表时间的宝石。山洞内阴暗潮湿，弥漫着一股神秘的气息。李晓慧小心翼翼地向前走着，突然听到一阵低沉的轰鸣声。

“小心！”她刚喊出声，一块巨大的岩石从洞顶滚落，眼看就要砸中前面的队员。李晓慧来不及多想，迅速冲过去，用力推开队员。就在这时，一道光芒从她口袋里闪过，原来是她从古代带回来的老人送的锦囊。光芒包裹住李晓慧和队员，岩石砸在光芒上，竟被弹开。

“这……这是怎么回事？”队员惊魂未定地问道。

李晓慧也一脸惊讶，她打开锦囊，发现里面的一本小册子上多了几行发光的文字：“危难之际，护你周全；时空相连，缘法自显。”她隐隐觉得，这锦囊和这次考察有着千丝万缕的联系。

继续深入山洞，他们在一处隐蔽的石壁后发现了一个精致的盒子。李晓慧打开盒子，一颗散发着柔和蓝光的宝石静静躺在里面，正是代表时间的宝石。

带着时间宝石，考察队马不停蹄地前往下一个地点——一座荒废的古城。根据线索，代表空间的宝石应该就藏在这里。古城中残垣断壁，荒草丛生，弥漫着一股死寂的气息。李晓慧和队员们仔细搜索着每一处角落，就在大家感到疲惫不堪时，李晓慧在一座古老的塔下发现了异样。

塔的底部有一个神秘的图案，她轻轻触摸图案，突然，塔内传来一阵机械转动的声音。紧接着，塔的一侧缓缓打开，露出一个密室。李晓慧走进密室，看到一个石台上放着一颗闪烁着五彩光芒的宝石，正是代表空间的宝石。

然而，就在他们准备离开古城时，一群神秘人突然出现，将他们团团围住。为首的是一个戴着黑色面具的男子，声音冰冷：“把宝石交出来，否则你们都别想活着离开。”

张教授站出来，义正言辞地说：“这些宝石是历史的瑰宝，你们休想抢走！”

神秘男子冷笑一声，一挥手，手下便向考察队扑来。李晓慧和队员们迅速拿起身边的工具作为武器，与神秘人展开激烈搏斗。李晓慧一边抵挡攻击，一边思索对策。突然，她灵机一动，将时间宝石和空间宝石放在一起，瞬间，一股强大的力量爆发出来，光芒笼罩住整个古城。

神秘人被光芒震慑，纷纷后退。李晓慧趁机带着队员们逃离古城，回到遗迹。此时，只剩下代表能量的宝石还未找到。