当宣布内阁五臣的人选之后，李邦华接着宣布了诸多任命。

巩永固为禁军统领，统率皇城内所有禁军及护卫，专司护卫宫城安全。

监军太监方正化升代替庞天寿为御马监太监指挥，统辖天子亲军四卫营，防守皇城四门。

腾骧左卫守北安门，腾骧右卫守南安门，武骧左卫守西安门，武骧左卫守东安门，并做好随时增援各门的准备。

原御马监指挥庞天寿升任司礼监秉笔太监，随侍崇祯皇帝。

方以智升为礼部主事，主宣传。携冯梦龙、傅山两人，负责对城内将士、百官、及百姓的舆论宣传并控制其走向。

暂撤宗人府，大理寺，留刑部，以太尉万炜为主事，凡遇不法之事，无论其身份，都有逮捕之权。

金声为右都御使，协助万炜，并负责城内百姓的安置和管辖。

锦衣卫指挥同知李若琏暂代指挥使之职，统辖城内所有锦衣卫，负责内外情报的收集。

五阁部之外，同时设立五军战时都督府。

杨廷麟、王彦章、唐通、李国帧、刘肇基、王承恩、刘文炳等七人暂为都督府人员，专司守城事宜。

军政分离，五阁老只能建议，而不得干涉。

京师九门，西直门、东直门、德胜门，全部用青石条堵塞。西城留阜成门、北城留安定门、东城留朝阳门。

南城三门正阳门，宣武门和崇文门暂时不闭，但在宣武门和崇文门内准备石条。若将来外城失陷，立即堵塞。

五军营左军都督杨崇守西城阜成门。

前军都督姜应魁守北城安定门。

后军都督金炫守东城朝阳门。

右军都督褚宪章守南城，控正阳、宣武、崇文三门。

中军都督李国帧率中军、刘文炳率神机营全部暂守外城。

城内一百三十六尊红夷大炮，三十六尊给外城，西、北两面城墙各三十尊，东面和南面各二十尊。

其他弗朗机炮、虎蹲炮也按照这个比例分配。