这天，樱木博士在研究所内向众人传授着有关宠物蛋的知识，顺便提到至今还没有人见过宝可梦生蛋的瞬间。

听到这话，小智表示自己旅行这么久，也只见过宠物蛋孵化的样子。

见小智阅历比自己丰富，好胜的小豪有些不甘心，当即表示要和小智去寻找宠物蛋。

而另一边，枯叶市的神奇宝贝中心，乔伊小姐正满脸愁容的看着一颗蓝色纹路的宠物蛋。

这只宠物蛋已经在孵化箱中许久，一只没有动静，如果不是仪器显示各项数据正常，她还以为已经夭折了。

与此同时，小智二人来到一处树林中寻找宠物蛋的踪迹，结果遇到了晒太阳的蛋蛋，小豪见状也是毫不客气的丢出精灵球直接收服。

这时，洛托姆手机显示有世界锦标赛的选手邀战，小智自然是不会拒绝。

比赛规则为1vs1，对方派出肯泰罗，小智则使用皮卡丘，对战过程中小智莫名的与神奇宝贝中心的那颗宠物蛋产生一丝联系。

最终一番激战下小智获得胜利，但皮卡丘尾巴也收到些许伤害，于是便带其去神奇宝贝中心治疗。

在皮卡丘接受治疗的时候，小智突然感觉到有声音在呼唤自己，随后就走到了那颗宠物蛋面前。